문의하신 내용이 조금 애매해보입니다.
최종질문이 roi 헤더 파일 생성이 맞는지요? ENVI ROI 파일에는 헤더가 필요치 않습니다. 다른 부분에서 문제가 있으신 것 같습니다.

ROI는 ENVI에서 생성해놓으신 것으로 이해를 했습니다.
이 경우 envi_restore_rois, ‘저장경로\저장이름.roi’ 로 restore를 하시고
roi_ids = envi_get_roi_ids(fid=fid, roi_colors=roi_colors, roi_names=class_names)
와 같이 사용하시어 id 번호를 부여받고, 저장 당시의 클래스 이름과 색을 읽어들이게 됩니다.
이후 envi_doit, ‘class_doit’, fid=fid … 과 같이 사용하시면 됩니다.

pos 키워드는 다중 밴드 영상에 대해 classification 수행 시 필요한 밴드 번호를 지정하는 내용입니다. 하시고자 하는 내용과는 무관한 내용으로 보입니다.